คณะครุศาสตร์

• หลักสูตรการศึกษาปฐมวัย
• หลักสูตรการประถมศึกษา
• หลักสูตรสุขศึกษาและพลศึกษา
• หลักสูตรการสอนอิสลามศึกษา ป.ตรี
• หลักสูตรการสอนอิสลามศึกษา ป.โท
• หลักสูตรภาษาอังกฤษและเทคโนโลยีการศึกษา
• หลักสูตรวิธีวิทยาการวิจัยเพื่อการพัฒนา
• หลักสูตรการบริหารการศึกษา
• ฝ่ายฝึกประสบการณ์วิชาชีพครู
• โรงเรียนสาธิต

คณะมนุษยศาสตร์และสังคมศาสตร์

• หลักสูตรภาษาไทย คบ.
• หลักสูตรภาษาไทย ศศบ.
• หลักสูตรภาษาอังกฤษ คบ.
• หลักสูตรภาษาอังกฤษ ศศบ.
• หลักสูตรภาษามลายู คบ.
• หลักสูตรภาษามลายู ศศบ.
• หลักสูตรภาษาจีน
• หลักสูตรภาษาอาหรับ
• หลักสูตรสารสนเทศศาสตร์
• หลักสูตรการพัฒนาชุมชน
• หลักสูตรสังคมศึกษา
• หลักสูตรรัฐประศาสนศาสตร์
• หลักสูตรนิติศาสตร์
• หลักสูตรการออกแบบศิลปกรรม
• หลักสูตรออกแบบนวัตกรรมทัศนศิลป์
• หลักสูตรรัฐศาสตรบัณฑิต สาขาวิชาการปกครองและกฏหมายมหาชน

คณะวิทยาศาสตร์เทคโนโลยีและการเกษตร

• หลักสูตรฟิสิกส์
• หลักสูตรชีววิทยา
• หลักสูตรจุลชีววิทยา
• หลักสูตรเคมี
• หลักสูตรคณิตศาสตร์
• หลักสูตรวิทยาศาสตร์ทั่วไป
• หลักสูตรการสอนวิทยาศาสตร์
• หลักสูตรวิทยาการคอมพิวเตอร์
• หลักสูตรเทคโนโลยีสารสนเทศ
• หลักสูตรคอมพิวเตอร์
• หลักสูตรเทคโนโลยีมัลติมีเดีย
• หลักสูตรวิทยาศาสตร์สิ่งแวดล้อม
• หลักสูตรสุขศึกษา
• หลักสูตรสิ่งแวดล้อมกับการพัฒนา
• หลักสูตรเกษตรศาสตร์
• หลักสูตรวิทยาศาสตร์และเทคโนโลยีการอาหาร
• หลักสูตรสัตวศาสตร์
• หลักสูตรการจัดการทรัพยากรธรรมชาติและสิ่งแวดล้อม
• งานประกันคุณภาพ

คณะวิทยาการจัดการ

• หลักสูตรนิเทศศาสตร์
• หลักสูตรวิทยุกระจายเสียง วิทยุโทรทัศน์และสื่อดิจิทัล
• หลักสูตรการจัดการ
• หลักสูตรการตลาด
• หลักสูตรการบัญชี
• หลักสูตรคอมพิวเตอร์ธุรกิจ
• หลักสูตรการจัดการธุรกิจท่องเที่ยว
• หลักสูตรธุรกิจระหว่างประเทศ
• หลักสูตรการเงินและการธนาคาร
• หลักสูตรบริหารธุรกิจมหาบันฑิต
• หลักสูตรบริหารธุรกิจบัณฑิต สาขาวิชาเศรษฐศาสตร I I ธุรกิจ
• หลักสูตรการจัดการธุรกิจการค้าสมัยใหม่
• หลักสูตรการจัดการธุรกิจดิจิทัลและนวัตกรรม

สำนักงานอธิการบดี

• กองกลาง
  • งานธุรการและสารบรรณ
  • งานการเจ้าหน้าที่
  • งานพัสดุ
  • งานการคลัง
  • งานอาคารสถานที่
• กองนโยบายและแผน
  • งานบริหารทั่วไป
  • งานติดตามและประเมินผล
  • งานแผนงานและงบประมาณ
  • งานออกแบบและวางแผนพัฒนาอาคารและโครงสร้างพื้นฐาน
• กองบริการการศึกษา
  • งานบริหารทั่วไป
  • งานจัดการศึกษา
  • งานทะเบียนและประมวลผล
  • งานมาตรฐานการศึกษา
• สำนักงานประกันคุณภาพ
  • งานส่งเสริมพัฒนาระบบประกันคุณภาพ
  • งานตรวจสอบคุณภาพ
  • งานประเมินคุณภาพ
  • งานควบคุมคุณภาพ
• สำนักงานบัณฑิตศึกษา
  • งานบริหารทั่วไป
  • งานส่งเสริมบัณฑิตศึกษา
  • งานจัดการศึกษาระดับบัณฑิตศึกษา
  • งานมาตรฐานบัณฑิตศึกษา
• สำนักงานเลขานุการ
  • งานบริหารทั่วไป
  • งานกิจการสภามหาวิทยาลัย
  • งานวิเทศสัมพันธ์
  • งานประชาสัมพันธ์และมวลชนสัมพันธ์
• กองพัฒนานักศึกษา
  • งานบริหารทั่วไป
  • งานแนะแนว
  • งานสวัสดิการนักศึกษา
  • งานพัฒนานักศึกษา
• หน่วยงานในกำกับ
  • สถานีวิทยุ
  • สำนักพิมพ์
  • ศูนย์บ่มเพาะวิสาหกิจ มหาวิทยาลัยราชภัฏยะลา
  • โครงการสะพานเสริมสร้างประชาธิปไตย มหาวิทยาลัยราชภัฏยะลา
  • ศูนย์ภาษาและอาเซียนศึกษา (ศภอ.)
  • สถาบันฝึกอบรมเพื่อพัฒนาชายแดนใต้
  • ศูนย์ส่งเสริมการทำผลงานวิชาการ
• โครงการสำคัญของมหาวิทยาลัย
  • ศูนย์ส่งเสริมและพัฒนาท้องถิ่น

สำนักวิทยบริการและเทคโนโลยีสารสนเทศ

• สำนักงานผู้อำนวยการ
• ศูนย์คอมพิวเตอร์
  • งานระบบเครือข่าย
  • งานเทคโนโลยีสารสนเทศเพื่อการบริหาร
  • งานเทคโนโลยีสารสนเทศเพื่อการศึกษา
• ศูนย์บรรณสารสนเทศ
  • งานบริการและเผยแพร่สารสนเทศ
  • งานพัฒนาทรัพยากรสารสนเทศ

หอพักนักศึกษา มหาวิทยาลัยราชภัฏยะลา

หน่วยงานตรวจสอบภายใน

สถาบันวิจัยและพัฒนาชายแดนใต้

• สำนักงานผู้อำนวยการ
  • งานบริหารทั่วไป
  • ศูนย์วิจัยความหลากหลายทางชีวภาพ
  • งานพัฒนาทรัพยากรมนุษย์
  • งานวารสาร
  • งานสำรวจข้อมูล (Poll)
  • งานส่งเสริมการวิจัยข้อมูลท้องถิ่น
• ศูนย์ศิลปวัฒนธรรม
  • งานบริหารทั่วไป
  • งานอนุรักษ์และเผยแพร่วัฒนธรรม
• ศูนย์วิทยาศาสตร์และวิทยาศาสตร์ประยุกต์
  • งานบริหารทั่วไป
  • งานบริการและเผยแพร่
  • คลินิกเทคโนโลยี

สถาบันพัฒนาครูและบุคลากรทางการศึกษาชายแดนใต้

• หน่วยวิจัย พัฒนา และให้บริการด้านพหุภาษาการศึกษา (MTB MLE Center)
• หน่วยวิจัย พัฒนา ให้บริการสื่อ และนวัตกรรมทางการศึกษา